Mientras que en el Torneo de Clausura 2003 fue eliminado en la misma instancia frente a Cobreloa. Esta filial radicó durante varias temporadas en la segunda división y recientemente en una reestructuración del equipo se decidió que ocuparía un lugar en la tercera división, donde actualmente juega dentro del grupo 2. Su sede es el Estadio Lagunas en la ciudad de Lagunas, camiseta uruguay mundial tienda sevilla fc Oaxaca.